RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048	CTSB	P07858	339 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	C1S	P09871	688 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PIRT	P0C851	137 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PYGM	P11217	842 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCNB1	P14635	433 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCNC	P24863	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	AKT2	P31751	481 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HNF1B	P35680	557 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ETV3	P41162	512 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ARHGAP25	P42331	645 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DPP6	P42658	865 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MMP13	P45452	471 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCT8	P50990	548 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SHC2	P98077	582 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	BCL2L1	Q07817	233 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PCDH1	Q08174	1060 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	WASHC5	Q12768	1159 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	INPP5A	Q14642	412 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PDK2	Q15119	407 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC157	Q569K6	752 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MARC1	Q5VT66	337 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	LRRC38	Q5VT99	294 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KAZN	Q674X7	775 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048		Q6ZVL8	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DPPA4	Q7L190	304 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GLRX5	Q86SX6	157 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	IQCH	Q86VS3	1027 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GATA6	Q92908	595 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SCAMP4	Q969E2	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TADA1	Q96BN2	335 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	COQ10A	Q96MF6	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF599	Q96NL3	588 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TRIB3	Q96RU7	358 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	IL12RB2	Q99665	862 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	GDF3	Q9NR23	364 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6	3e-12	■■■■□ 19.8
MDM2-234	ENST00000546048	DMTF1	Q9Y222	760 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CHKB	Q9Y259	395 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ZZEF1	O43149	2961 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PRR19	A6NJB7	356 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ENC1	O14682	589 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	APOL1	O14791	398 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PJA2	O43164	708 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SPOP	O43791	374 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CST8	O60676	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TM7SF2	O76062	418 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CLDN7	O95471	211 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	FTCD	O95954	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CSF2	P04141	144 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	ITGAV	P06756	1048 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	KRT7	P08729	469 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	TPM1	P09493	284 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DRD2	P14416	443 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	DES	P17661	470 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	PTPN3	P26045	913 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SERPINA4	P29622	427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	CD86	P42081	329 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-234	ENST00000546048	SLC1A1	P43005	524 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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