RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	CIITA	P33076	1130 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC16A2	P36021	539 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SUOX	P51687	545 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	PROK1	P58294	105 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	PPARD	Q03181	441 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	TFF2	Q03403	129 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	GRAP	Q13588	217 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CES5A	Q6NT32	575 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS33A	Q96AX1	596 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF183	Q96D59	192 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	GAD1	Q99259	594 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A096LPK6	155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM170A	A1A519	330 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	URAD	A6NGE7	173 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPB6	O14558	160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF8	O76064	485 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	C22orf31	O95567	290 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	QDPR	P09417	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CPT2	P23786	658 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	EPHB2	P29323	1055 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPZA2	P47755	286 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR12	P47775	334 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	LMAN1	P49257	510 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	LIG4	P49917	911 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF81	P51508	661 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPS	Q13938	189 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	NAB2	Q15742	525 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	MIDN	Q504T8	468 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	EME1	Q96AY2	570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	DGAT2	Q96PD7	388 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SNHG1-222	ENST00000545308	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74

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