RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 ARSIQ5FYB1 569 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CNSTQ6PJW8 725 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CHFRQ96EP1 664 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 TMEM165Q9HC07 324 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 KLHL33A6NCF5 533 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CLDN7O95471 211 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CTSLP07711 333 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PRSS56P0CW18 603 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 HLA-EP13747 358 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SAT1P21673 171 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 KCNA5P22460 613 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PMLP29590 882 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 MC4RP32245 332 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 BLMHQ13867 455 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 ZNF234Q14588 700 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 USP10Q14694 798 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 C16orf46Q6P387 395 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SPATA21Q7Z572 469 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 MAGEB18Q96M61 343 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 VPS11Q9H270 941 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 ZNF358Q9NW07 568 aa8.66□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CFAP73A6NFT4 308 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 A8MX80 341 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 H7C0S8 307 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 S1PR4O95977 384 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 APODP05090 189 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 MPOP05164 745 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SOX9P48436 509 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 POLD2P49005 469 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CSRP3P50461 194 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CLCN5P51795 746 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SEMA3AQ14563 771 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CDKN3Q16667 212 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 ANO7Q6IWH7 933 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 LRCH3Q96II8 777 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 DCTN4Q9UJW0 460 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 EMCNQ9ULC0 261 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 A0A096LPK6 155 aa8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-210ENST00000541576 C2P06681 752 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 STC1P52823 247 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SEMG2Q02383 582 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 PEX6Q13608 980 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 AAK1Q2M2I8 961 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 RAPH1Q70E73 1250 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 TSPAN33Q86UF1 283 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CEP97Q8IW35 865 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 MAGEC3Q8TD91 643 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 DCDC2Q9UHG0 476 aa8.65□□□□□ -1.02
THBS3-210ENST00000541576 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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THBS3-210ENST00000541576 NFKBIAP25963 317 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 SERPINB4P48594 390 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 SLC12A2P55011 1212 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 IRX4P78413 519 aa8.65□□□□□ -1.03
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THBS3-210ENST00000541576 POU4F1Q01851 419 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 PDK4Q16654 411 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 LRRC66Q68CR7 880 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 STK40Q8N2I9 435 aa8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
THBS3-210ENST00000541576 NDNQ99608 321 aa8.65□□□□□ -1.03
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