RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 GIMD1P0DJR0 217 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ACTR1BP42025 376 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PGDP52209 483 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ACTR1AP61163 376 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TERF2Q15554 542 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TEX44Q53QW1 395 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINA9Q86WD7 417 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MTERF3Q96E29 417 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 REEP1Q9H902 201 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PDE9AO76083 593 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ADH1BP00325 375 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 IL10RBQ08334 325 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RPTNQ6XPR3 784 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF605Q86T29 641 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PHC3Q8NDX5 983 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 BRSK1Q8TDC3 778 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RNFT2Q96EX2 444 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ITCHQ96J02 903 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 FZD10Q9ULW2 581 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 UBXN7O94888 489 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CFHP08603 1231 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TSPAN19P0C672 248 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ALADP13716 330 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 KCNA3P22001 575 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 DAOAP59103 153 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 COX10Q12887 443 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SQLEQ14534 574 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 FBXO30Q8TB52 745 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PSMG2Q969U7 264 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 APOL4Q9BPW4 351 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 BDH2Q9BUT1 245 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf50Q9BV19 199 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 AK5Q9Y6K8 562 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 IQCF5A8MTL0 148 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PIK3R1P27986 724 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 LRPAP1P30533 357 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 HECTD2Q5U5R9 776 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 GALNT7Q86SF2 657 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 DNASE1L2Q92874 299 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PTPN18Q99952 460 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 VWA7Q9Y334 891 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PEX12O00623 359 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SERPINB7O75635 380 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TALDO1P37837 337 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SEMG2Q02383 582 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 DMTNQ08495 405 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 NAE1Q13564 534 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RPAINQ86UA6 219 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF276Q8N554 614 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 UBR7Q8N806 425 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RPS6KA6Q9UK32 745 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 MATN3O15232 486 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PRKCGP05129 697 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ACP5P13686 325 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 BEND5Q7L4P6 421 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SNX32Q86XE0 403 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SLC9A6Q92581 669 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 PANX1Q96RD7 426 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRB-204ENST00000538708 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.3 ms