RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	BNIPL	Q7Z465	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846		B4DGG1	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ALOX15B	O15296	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	AGT	P01019	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ETS1	P14921	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	TGM2	P21980	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PTPN3	P26045	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CCT8	P50990	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	TAS2R38	P59533	333 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CDK18	Q07002	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	GRM3	Q14832	879 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	LRRC66	Q68CR7	880 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	BBS12	Q6ZW61	710 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	NUS1	Q96E22	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	GPR39	O43194	453 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	MTA2	O94776	668 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	APOC2	P02655	101 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	APRT	P07741	180 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	GNPDA1	P46926	289 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CLDN6	P56747	220 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PPARD	Q03181	441 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	POU6F1	Q14863	301 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	IRF4	Q15306	451 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CLVS1-205	ENST00000519846	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846		A6NNZ2	444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF185	O15231	689 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	SIAH2	O43255	324 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	MTSS1	O43312	755 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	ANXA6	P08133	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CLVS1-205	ENST00000519846	VIPR1	P32241	457 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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