RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516443.1

RNU6-687P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 687, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-687P, Length 89 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ADNPQ9H2P0 1102 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MKS1Q9NXB0 559 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 DNAJB4Q9UDY4 337 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MID2Q9UJV3 735 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PKP3Q9Y446 797 aa-0.68□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MEGF6O75095 1541 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 XPOTO43592 962 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MAGEC1O60732 1142 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 DEDDO75618 318 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 STAM2O75886 525 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 KBTBD11O94819 623 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TGDSO95455 350 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 LARGE1O95461 756 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 DDAH2O95865 285 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM106CPP0CH98 169 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TFPIP10646 304 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ODC1P11926 461 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 BTF3P20290 206 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PRKACGP22612 351 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 AHRP35869 848 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MBTD1Q05BQ5 628 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPS1Q13098 491 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 IQCCQ4KMZ1 466 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 CYP4A22Q5TCH4 519 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TTI2Q6NXR4 508 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 G2E3Q7L622 706 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ISCA2Q86U28 154 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMEM139Q8IV31 216 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 SFTPA2Q8IWL1 248 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 KLHDC1Q8N7A1 406 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF491Q8N8L2 437 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MCPH1Q8NEM0 835 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 RASSF8Q8NHQ8 419 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PIGTQ969N2 578 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 HDAC11Q96DB2 347 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 CALML4Q96GE6 196 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 APIPQ96GX9 242 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAR2Q96K12 515 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 WDFY2Q96P53 400 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 FRG2BQ96QU4 278 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 C16orf70Q9BSU1 422 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TINAGQ9UJW2 476 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 OSGIN2Q9Y236 505 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 WDR37Q9Y2I8 494 aa-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP-0.69□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 POGZQ7Z3K3 1410 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 A0A0U1RQS6 177 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TMEM247A6NEH6 219 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF878C9JN71 531 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF861PO60384 105 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 FAM155BO75949 473 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 INMTO95050 263 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 NPR1P16066 1061 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF23P17027 643 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 GPX3P22352 226 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 YWHAQP27348 245 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 LIG4P49917 911 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 CACNB3P54284 484 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 TAS2R50P59544 299 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 SERINC3Q13530 473 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 NR1D2Q14995 579 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 VWA2Q5GFL6 755 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 SLC36A4Q6YBV0 504 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 HAUS6Q7Z4H7 955 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MON1AQ86VX9 555 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 MICU3Q86XE3 530 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 HOGA1Q86XE5 327 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 NUP37Q8NFH4 326 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 OR2T11Q8NH01 316 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PPM1EQ8WY54 764 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 SUSD6Q92537 303 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 IL22RA2Q969J5 263 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ERGIC1Q969X5 290 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ZNF597Q96LX8 424 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 UBAC1Q9BSL1 405 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PINK1Q9BXM7 581 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
RNU6-687P-201ENST00000516443 PRDM11Q9NQV5 511 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms