RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa24.54■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 B4GAT1O43505 415 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 LIPCP11150 499 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 GALNT13Q8IUC8 556 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF843Q8N446 348 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 EXD1Q8NHP7 514 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 TTC9Q92623 222 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 LYSMD1Q96S90 227 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 AGAP2Q99490 1192 aa24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 INPP4BO15327 924 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CBFA2T2O43439 604 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 CLDN7O95471 211 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PRLP01236 227 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 KDELR1P24390 212 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 GPR3P46089 330 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 MAPK10P53779 464 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 LRP8Q14114 963 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 MESDQ14696 234 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PYCR3Q53H96 274 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 RAPGEF5Q92565 580 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 COX14Q96I36 57 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 RNF157Q96PX1 679 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 NUDT22Q9BRQ3 303 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa24.52■■□□□ 1.52
ALYREF-203ENST00000511412 KALRNO60229 2985 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ATMQ13315 3056 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 LRRD1A4D1F6 860 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 AKR1B10O60218 316 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 PRAMEF10O60809 474 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ETV5P41161 510 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 CD86P42081 329 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 C16orf72Q14CZ0 275 aa24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF487B1APH4 448 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 KCNK1O00180 336 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ASMTLO95671 621 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 TPM1P09493 284 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 TGIF1Q15583 401 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 USP53Q70EK8 1073 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 PLD5Q8N7P1 536 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 USP7Q93009 1102 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 PKD2L2Q9NZM6 624 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 FOXJ2Q9P0K8 574 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 SEPT10Q9P0V9 454 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 VPS18Q9P253 973 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 HEY1Q9Y5J3 304 aa24.5■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 HGSO14964 777 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 PPM1DO15297 605 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 JCHAINP01591 159 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 MMP2P08253 660 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 CD1CP29017 333 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB17Q13105 803 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 QPCTQ16769 361 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 VSIG1Q86XK7 387 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 CCHCR1Q8TD31 782 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC74BQ96LY2 380 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ADGRE3Q9BY15 652 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ZMYND15Q9H091 742 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ABHD10Q9NUJ1 306 aa24.49■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 C9orf172C9J069 976 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 CD82P27701 267 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 SPINT3P49223 89 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 LY6DQ14210 128 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM164Q5U3C3 297 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 RCBTB1Q8NDN9 531 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 KCNK4Q9NYG8 393 aa24.48■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ANKRD66B4E2M5 251 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 APOL1O14791 398 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC6O75061 913 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 KRT1P04264 644 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP25P42331 645 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 FASLGP48023 281 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 LIMK2P53671 638 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 AP1B1Q10567 949 aa24.47■■□□□ 1.51
ALYREF-203ENST00000511412 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms