RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502714.1

YIPF3-210, Transcript of Yip1 domain family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene YIPF3, Length 795 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3-210ENST00000502714 CEP192Q8TEP8 1941 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 H7C0S8 307 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 GFRA3O60609 400 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 AVILO75366 819 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 PRAMEF1O95521 474 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 CER1O95813 267 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 WNT1P04628 370 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 ITGALP20701 1170 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 DRG2P55039 364 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 ARL4CP56559 192 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 KIAA1024LP59773 190 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 CDK3Q00526 305 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 KIF19Q2TAC6 998 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 FAM151BQ6UXP7 276 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 MACC1Q6ZN28 852 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 PARGQ86W56 976 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 WDR92Q96MX6 357 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 VPS35Q96QK1 796 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 NAT9Q9BTE0 207 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 KIFC1Q9BW19 673 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 TEX101Q9BY14 249 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 FAM129AQ9BZQ8 928 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 GPR27Q9NS67 375 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 SYBUQ9NX95 663 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 KCTD3Q9Y597 815 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
YIPF3-210ENST00000502714 YKT6O15498 198 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SOD1P00441 154 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 ENGP17813 658 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 PAMP19021 973 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 CTSKP43235 329 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 BLKP51451 505 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 TUBB4BP68371 445 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 PRAMEP78395 509 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 IRX4P78413 519 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 CRADDP78560 199 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 TMPRSS15P98073 1019 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SLC7A5Q01650 507 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 GUCY2DQ02846 1103 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 ACVR1Q04771 509 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 CHRNA6Q15825 494 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 PRR23CQ6ZRP0 262 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 CCNJLQ8IV13 435 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 TCEAL3Q969E4 200 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 ULK4Q96C45 1275 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 LRRC39Q96DD0 335 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SOX13Q9UN79 622 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SNX11Q9Y5W9 270 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 PLXNA2O75051 1894 aa11.89□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 FRYLO94915 3013 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 LNP1A1A4G5 178 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 CCDC78A2IDD5 438 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 H3BM21 787 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 TNFRSF10CO14798 259 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 INPP4BO15327 924 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 TTC4O95801 387 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 POLBP06746 335 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 GPR89BP0CG08 455 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 PSMA3P25788 255 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 MC4RP32245 332 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 PLTPP55058 493 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 NFATC2Q13469 925 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 FZD2Q14332 565 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 PTPRCAPQ14761 206 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 HLA-BQ31612 363 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 BBS9Q3SYG4 887 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 GPR33Q49SQ1 333 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.88□□□□□ -0.51
YIPF3-210ENST00000502714 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.7 ms