RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDH1Q08174 1060 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC32Q14392 662 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9A5Q14940 896 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CLCA4Q14CN2 919 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ANGPT1Q15389 498 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP2A13Q16696 494 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PFKFB4Q16877 469 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SFR1Q86XK3 245 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR7Q8TB68 274 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.683e-8■■□□□ 14.2
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RABGGTB-213ENST00000496055 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 S1PR5Q9H228 398 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 UVRAGQ9P2Y5 699 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DCTN4Q9UJW0 460 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 USP18Q9UMW8 372 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PIEZO1Q92508 2521 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR89AB7ZAQ6 455 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BM21 787 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CDH16O75309 829 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GPX5O75715 221 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DCTN3O75935 186 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FGF19O95750 216 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GLP2RO95838 553 aa4.57□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 THP07101 528 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CFHP08603 1231 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR89BP0CG08 455 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 EPCAMP16422 314 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GALP22466 123 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HTR7P34969 479 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TIE1P35590 1138 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CLK2P49760 499 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CASP5P51878 434 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SPCS3P61009 180 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF33AQ06730 810 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STRN3Q13033 797 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CUL4AQ13619 759 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNAB1Q14722 419 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STAT4Q14765 748 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MTF1Q14872 753 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GSTA3Q16772 222 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LXNQ9BS40 222 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAM33Q9BZ11 813 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OSBPL6Q9BZF3 934 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GPR88Q9GZN0 384 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 EPB41L1Q9H4G0 881 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CA14Q9ULX7 337 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF24Q9Y225 148 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RAD54BQ9Y620 910 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SIP14410 1827 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MUI8 341 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 J3QW42 95 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TAF4O00268 1085 aa4.57□□□□□ -1.68
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RABGGTB-213ENST00000496055 BUB1O43683 1085 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TBC1D4O60343 1298 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC22O60826 627 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HSF2BPO75031 334 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC22BO75396 215 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFRSF21O75509 655 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRAMEF12O95522 483 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DHFRP00374 187 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 APOC1P02654 83 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ASGR2P07307 311 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LYNP07948 512 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR35P0CG20 571 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A3P11169 496 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SRCP12931 536 aa4.57□□□□□ -1.68
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