RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487186.5

FAAP20-213, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 2

Gene FAAP20, Length 3,576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-213	ENST00000487186	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	FZD8	Q9H461	694 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PLLP	Q9Y342	182 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	FAM149A	A5PLN7	773 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	KCNK1	O00180	336 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	AGRP	O00253	132 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PSTPIP1	O43586	416 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	GRM5	P41594	1212 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ADIG	Q0VDE8	80 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	WSCD1	Q658N2	575 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ST8SIA2	Q92186	375 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PIK3R1	P27986	724 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ZNF33B	Q06732	778 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	FAM155B	O75949	473 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	BMP4	P12644	408 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	GPD1	P21695	349 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	GSTM2	P28161	218 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	HNF1B	P35680	557 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	OR8K3	Q8NH51	312 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	NXNL1	Q96CM4	212 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	DOK1	Q99704	481 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ATP8B3	O60423	1300 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186		F8W810	466 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	PLD2	O14939	933 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SLC22A1	O15245	554 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	IFNA14	P01570	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	IDH3A	P50213	366 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SCNN1G	P51170	649 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	IL1RL1	Q01638	556 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CEACAM7	Q14002	265 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	DUSP7	Q16829	419 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	UBR7	Q8N806	425 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	TRIB2	Q92519	343 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CD101	Q93033	1021 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	BEX2	Q9BXY8	128 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	XYLB	O75191	536 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	ALAS2	P22557	587 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CD40LG	P29965	261 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SELPLG	Q14242	412 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SHE	Q5VZ18	495 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	SNX7	Q9UNH6	387 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAAP20-213	ENST00000487186		H0YJX3	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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