RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 IDH3BO43837 385 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ALDH1A2O94788 518 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA3P43357 314 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SCNN1GP51170 649 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 LRP8Q14114 963 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 HERC3Q15034 1050 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SCIMPQ6UWF3 145 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 LSMEM2Q8N112 164 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 DFFAO00273 331 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NME4O00746 187 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 IST1P53990 364 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SELENBP1Q13228 472 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CUZD1Q86UP6 607 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 LGI2Q8N0V4 545 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CRYBG2Q8N1P7 616 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SPPL2BQ8TCT7 592 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 BTRCQ9Y297 605 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PTGESO14684 152 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PGK1P00558 417 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 JCHAINP01591 159 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 INHBBP09529 407 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ALOX12P18054 663 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 BDNFP23560 247 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ACADSBP45954 432 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 GRB14Q14449 540 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 UBXN11Q5T124 520 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TAF2Q6P1X5 1199 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MICU2Q8IYU8 434 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PCED1BQ96HM7 432 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM74Q96NL1 305 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CSF3RQ99062 836 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 OSBPL10Q9BXB5 764 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 I6L893 689 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ARPC2O15144 300 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 INMTO95050 263 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NR2C2P49116 596 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 IPMKQ8NFU5 416 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MIOSQ9NXC5 875 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 U3KQV3 271 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MYADML2A6NDP7 307 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 HLCSP50747 726 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ARPP19P56211 112 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ARL13BQ3SXY8 428 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 GNASQ5JWF2 1037 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF773Q6PK81 442 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NPWQ8N729 165 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 WNT8BQ93098 351 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 RTP4Q96DX8 246 aa16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CCRL2O00421 344 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 F2P00734 622 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 BRCC3P46736 316 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINB10P48595 397 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TMBIM6P55061 237 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PHC1P78364 1004 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MROQ9BYG7 248 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 AASSQ9UDR5 926 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 USP22Q9UPT9 525 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D4O60343 1298 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CCNKO75909 580 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 B3GAT3O94766 335 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ALOX5P09917 674 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 NOS2P35228 1153 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms