RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 TROAPQ12815 778 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 BAK1Q16611 211 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF280DQ6N043 979 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF449Q6P9G9 518 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 DEFB132Q7Z7B7 95 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC13Q8IYE1 715 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 C1orf87Q8N0U7 546 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC8CQ8TDW0 803 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ST8SIA4Q92187 359 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC41A2Q96JW4 573 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 H2AFJQ9BTM1 129 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 USP44Q9H0E7 712 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 MMP28Q9H239 520 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 VEZTQ9HBM0 779 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 KCND2Q9NZV8 630 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 MPP6Q9NZW5 540 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PADI1Q9ULC6 663 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 FHOD3Q2V2M9 1422 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 NWD1Q149M9 1564 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa4□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 F9P00740 461 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CETPP11597 493 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 MCM3P25205 808 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PAFAH1B1P43034 410 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PTP4A2Q12974 167 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 FGFBP1Q14512 234 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC96Q2M329 555 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ESX1Q8N693 406 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CADM4Q8NFZ8 388 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 GRAMD2BQ96HH9 432 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PGLYRP2Q96PD5 576 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PCDH9Q9HC56 1237 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL1Q9NR64 748 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC6A13Q9NSD5 602 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 MCM9Q9NXL9 1143 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 MKLN1Q9UL63 735 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC88BA6NC98 1476 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 NPATQ14207 1427 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 P2RY10O00398 339 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 VCYO14598 125 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CNTROBQ8N137 903 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 UHRF2Q96PU4 802 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 PADI3Q9ULW8 664 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CAPN7Q9Y6W3 813 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ERICH3Q5RHP9 1530 aa3.98□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 C3P01024 1663 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 FGD6Q6ZV73 1430 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 TTC36A6NLP5 189 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC22A3O75751 556 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 EGFP01133 1207 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 IL7RP16871 459 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCD1P33897 745 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 GABRB2P47870 512 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGGTB-206ENST00000467748 SYT16Q17RD7 645 aa3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 213.4 ms