RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF284Q2VY69 593 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PLK5Q496M5 336 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CCDC38Q502W7 563 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DUPD1Q68J44 220 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PCGF5Q86SE9 256 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TRIM69Q86WT6 500 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BIRC7Q96CA5 298 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EID2BQ96D98 161 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SNF8Q96H20 258 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PWWP2AQ96N64 755 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 LYSMD1Q96S90 227 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MYOCQ99972 504 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR63Q9BZJ6 419 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB17Q9H0T7 212 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EBF2Q9HAK2 575 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CD84Q9UIB8 345 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL5AQ9Y689 179 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MEI4A8MW99 385 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 C10orf142B7Z368 130 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RAD51BO15315 384 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TM7SF2O76062 418 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOBTB1O94844 696 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ETV3P41162 512 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PTGER3P43115 390 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NPY2RP49146 381 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 STC1P52823 247 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CRADDP78560 199 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TMPRSS15P98073 1019 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK16Q00536 496 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SGCGQ13326 291 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 POU6F1Q14863 301 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MORF4L2Q15014 288 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TEX35Q5T0J7 233 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PMS2CLQ68D20 193 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 NEK5Q6P3R8 708 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MPP5Q8N3R9 675 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BBOF1Q8ND07 529 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MCUQ8NE86 351 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 COQ10AQ96MF6 247 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SERPINB12Q96P63 405 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 PRRX2Q99811 253 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EPC1Q9H2F5 836 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EPB41L5Q9HCM4 733 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FZD3Q9NPG1 666 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 GRHL1Q9NZI5 618 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 BFARQ9NZS9 450 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 HACD3Q9P035 362 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 WHRNQ9P202 907 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 KNL1Q8NG31 2342 aa8.4□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PPC4 97 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 PSMD11O00231 422 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 CCL22O00626 93 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT9AO14904 365 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 TP73O15350 636 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD28-208ENST00000463533 LATO43561 262 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms