RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 KERAO60938 352 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CAPN3P20807 821 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SLC6A4P31645 630 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 RGRP47804 291 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 FAM189BP81408 668 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CLCQ05315 142 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 IKBKEQ14164 716 aa20.39■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 NADK2Q4G0N4 442 aa20.39■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 KIAA1191Q96A73 305 aa20.39■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 EPB41L1Q9H4G0 881 aa20.39■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 SEPT3Q9UH03 358 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 POLG2Q9UHN1 485 aa20.39■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CCDC160A6NGH7 325 aa20.38■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 TIPRLO75663 272 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 RAD51Q06609 339 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 LCP2Q13094 533 aa20.38■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 OR2T3Q8NH03 318 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ZNF597Q96LX8 424 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 NACA2Q9H009 215 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 HTTP42858 3142 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 NME4O00746 187 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 AKAP10O43572 662 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 LBPP18428 481 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V1B2P21281 511 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ACLYP53396 1101 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ECT2LQ008S8 904 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CYTH1Q15438 398 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 NSMCE3Q96MG7 304 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SMIM14Q96QK8 99 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 DERL2Q9GZP9 239 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 PLK2Q9NYY3 685 aa20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CA12O43570 354 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ECI2O75521 394 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 VNN2O95498 520 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SREBF2Q12772 1141 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 GPR21Q99679 349 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SLC29A1Q99808 456 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 HCSTQ9UBK5 93 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 MED16Q9Y2X0 877 aa20.37■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 CHRM3P20309 590 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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IMP4-208ENST00000460766 GPR17Q13304 367 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 AP1ARQ63HQ0 302 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 RNF180Q86T96 592 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 FAM110BQ8TC76 370 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 SPATA17Q96L03 361 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 PSKH2Q96QS6 385 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ZIC5Q96T25 663 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 EGFL7Q9UHF1 273 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 AURKCQ9UQB9 309 aa20.37■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 LCHNA4D1U4 455 aa20.36■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.36■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 BTN3A1O00481 513 aa20.36■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 ACSL4O60488 711 aa20.36■□□□□ 0.85
IMP4-208ENST00000460766 GATMP50440 423 aa20.36■□□□□ 0.85
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