RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LMX1AQ8TE12 382 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DDI1Q8WTU0 396 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HVCN1Q96D96 273 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MYOCQ99972 504 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DCLK3Q9C098 648 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRN3Q9H3W5 708 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GDAP2Q9NXN4 497 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CROTQ9UKG9 612 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC4EQ9ULY5 219 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 POLHQ9Y253 713 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TGP01266 2768 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 A0A1W2PR48 441 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 H0YCG3 227 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 INPP4BO15327 924 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC31A1O15431 190 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SGTAO43765 313 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NRP2O60462 931 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 STC2O76061 302 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TBX18O95935 607 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IL1BP01584 269 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GLI1P08151 1106 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OR52Z1P0C646 297 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRLRP16471 622 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IFNAR1P17181 557 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MUTP22033 750 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RPA1P27694 616 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HLA-FP30511 346 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 VIPR1P32241 457 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CDK17Q00537 523 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LRP8Q14114 963 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PTK2BQ14289 1009 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NPY5RQ15761 445 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 VWA2Q5GFL6 755 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KLHDC10Q6PID8 442 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ADIPOR2Q86V24 386 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DAW1Q8N136 415 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CPXM2Q8N436 756 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 PPM1NQ8N819 430 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ARL10Q8N8L6 244 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 OR6C4Q8NGE1 309 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NRG4Q8WWG1 115 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A23Q9BV35 468 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DDA1Q9BW61 102 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 COMMD8Q9NX08 183 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LUZP4Q9P127 313 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SPASTQ9UBP0 616 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 GGA2Q9UJY4 613 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 AGAP1Q9UPQ3 857 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 ATP8B3O60423 1300 aa4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SEC16AO15027 2179 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 FAM92AA1XBS5 289 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 A6NCN8 305 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 LMO7DNF2Z398 122 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC16A6O15403 523 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 FRS3O43559 492 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 KRT86O43790 486 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 NEMFO60524 1076 aa4.09□□□□□ -1.75
ECHDC1-211ENST00000460558 DPM1O60762 260 aa4.09□□□□□ -1.75
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