RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.449e-17■■□□□ 13.7
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C6orf48-208ENST00000395788 VPS28Q9UK41 221 aa6.03□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.03□□□□□ -1.44
C6orf48-208ENST00000395788 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.03□□□□□ -1.44
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C6orf48-208ENST00000395788 KCTD3Q9Y597 815 aa6.03□□□□□ -1.44
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C6orf48-208ENST00000395788 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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C6orf48-208ENST00000395788 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.02□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 CEP44Q9C0F1 390 aa6.02□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 TRPV4Q9HBA0 871 aa6.02□□□□□ -1.45
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C6orf48-208ENST00000395788 OBP2AQ9NY56 170 aa6.02□□□□□ -1.45
C6orf48-208ENST00000395788 HACD3Q9P035 362 aa6.02□□□□□ -1.45
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