RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 ISXQ2M1V0 245 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 KAZNQ674X7 775 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 DOK6Q6PKX4 331 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 NRSN1Q8IZ57 195 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 FAM46DQ8NEK8 389 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 GPR156Q8NFN8 814 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM58Q8NG06 486 aa7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 EXD1Q8NHP7 514 aa7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 AGAP3Q96P47 875 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 LYSMD1Q96S90 227 aa7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 ABCG8Q9H221 673 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa7.63□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 TENM4Q6N022 2769 aa7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 D6RAR5 112 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 INPP4BO15327 924 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC14A2Q15849 920 aa7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 SLC30A9Q6PML9 568 aa7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM74Q86UV6 250 aa7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 P3H4Q92791 437 aa7.62□□□□□ -1.19
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SGMS1-201ENST00000361543 HAUS1Q96CS2 278 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 HIC2Q96JB3 615 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.62□□□□□ -1.192e-7■■■□□ 18.1
SGMS1-201ENST00000361543 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 TRIB3Q96RU7 358 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 AGAP2Q99490 1192 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 DESI2Q9BSY9 194 aa7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
SGMS1-201ENST00000361543 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
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