RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358355.5

USP20-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP20, Length 4,371 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-202ENST00000358355 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 OR10H2O60403 315 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 EDF1O60869 148 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ESR1P03372 595 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 IDO1P14902 403 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CRATP43155 626 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 HCAR3P49019 387 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 BLVRAP53004 296 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 NCF4Q15080 339 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 TXNDC8Q6A555 127 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ZNF544Q6NX49 715 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SLC35B2Q8TB61 432 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PLEKHO2Q8TD55 490 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ABCG8Q9H221 673 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 TMEM245Q9H330 911 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 DNAJC11Q9NVH1 559 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 KLHL20Q9Y2M5 609 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ZNF711Q9Y462 761 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 VIPP01282 170 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PIK3R1P27986 724 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 HOXD13P35453 343 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 IL5RAQ01344 420 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 AADATQ8N5Z0 425 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 AIF1LQ9BQI0 150 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PCDH12Q9NPG4 1184 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 USE1Q9NZ43 259 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SCML2Q9UQR0 700 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 NR2E1Q9Y466 385 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 TULP2O00295 520 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 UQCRBP14927 111 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PTGER3P43115 390 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CCR4P51679 360 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 COPZ1P61923 177 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SLC34A1Q06495 639 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 C1DQ13901 141 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PDGFRLQ15198 375 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CUZD1Q86UP6 607 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 OSTM1Q86WC4 334 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 GPR135Q8IZ08 494 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ZBTB2Q8N680 514 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 VMP1Q96GC9 406 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 MECRQ9BV79 373 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 OSBPL6Q9BZF3 934 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SLC17A7Q9P2U7 560 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ANAPC2Q9UJX6 822 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa12.85□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 MAN1A2O60476 641 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 COX4I1P13073 169 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SEMA5AQ13591 1074 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CYP1B1Q16678 543 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 EPS8L2Q9H6S3 715 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CCSER2Q9H7U1 834 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 REEP1Q9H902 201 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PIPSLA2A3N6 862 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 H3BN98 237 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CLOCKO15516 846 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SERPINI2O75830 405 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CCNDBP1O95273 360 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 KRT75O95678 551 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 EPORP19235 508 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SSR2P43308 183 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 MAGEA11P43364 429 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SF1Q15637 639 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SMOC2Q9H3U7 446 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 COPG2Q9UBF2 871 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ENPP3O14638 875 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 FGF18O76093 207 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 UNC5CO95185 931 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SOD2P04179 222 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 SERPINA6P08185 405 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PSME3P61289 254 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 OLFML1Q6UWY5 402 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CASP12Q6UXS9 341 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PRR23CQ6ZRP0 262 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ADHFE1Q8IWW8 467 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 MPP5Q8N3R9 675 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 NXNL1Q96CM4 212 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 TMEM109Q9BVC6 243 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 ABCG4Q9H172 646 aa12.84□□□□□ -0.35
USP20-202ENST00000358355 CLDND1Q9NY35 253 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms