RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332859.10

SUMO3-201, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUMO3, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-201ENST00000332859 RAB10P61026 200 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 IRF9Q00978 393 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ITGA9Q13797 1035 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PARM1Q6UWI2 310 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 USP45Q70EL2 814 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 KDM1BQ8NB78 822 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 NXPE3Q969Y0 559 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LYSMD1Q96S90 227 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SORT1Q99523 831 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 COL4A3Q01955 1670 aa20.05■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CAPN14A8MX76 684 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PRRT4C9JH25 899 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TRIM13O60858 407 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PMLP29590 882 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MC4RP32245 332 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LTBRP36941 435 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 STC1P52823 247 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 WASHC2DQ5SRD0 308 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MTSS1LQ765P7 747 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 RILPQ96NA2 401 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TCF12Q99081 682 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 DOCK8Q8NF50 2099 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 A8MUI8 341 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GDI1P31150 447 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GJA4P35212 333 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SEMA3AQ14563 771 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GRIN2CQ14957 1233 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 COL19A1Q14993 1142 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TTC7BQ86TV6 843 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TERB1Q8NA31 727 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 FAM13CQ8NE31 585 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 FGF14Q92915 247 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SCRN2Q96FV2 425 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 OMDQ99983 421 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 IL36AQ9UHA7 158 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.04■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PFDN6O15212 129 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 BMP1P13497 986 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 OPRD1P41143 372 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TAS2R39P59534 338 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MESP2Q0VG99 397 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 CDKN3Q16667 212 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TPRG1Q6ZUI0 275 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PHTF2Q8N3S3 785 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TTC8Q8TAM2 541 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 NDNQ99608 321 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 OXSMQ9NWU1 459 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ACOT9Q9Y305 439 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 MYO9BQ13459 2157 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 LAMA3Q16787 3333 aa20.03■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 A0A087X1B8 175 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 A0A0U1RQS6 177 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GYG2O15488 501 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 GMPRP36959 345 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 HECTD2Q5U5R9 776 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 AGAP11Q8TF27 550 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 UCMAQ8WVF2 138 aa20.02■□□□□ 0.8
SUMO3-201ENST00000332859 EID2BQ96D98 161 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms