RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 OVGP1Q12889 678 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF460Q14592 562 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM215Q68D42 235 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 USP45Q70EL2 814 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DTX3LQ8TDB6 740 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 FRS2Q8WU20 508 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 FGF13Q92913 245 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 EID2BQ96D98 161 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SCYL1Q96KG9 808 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC37BQ96QE4 947 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SMIM14Q96QK8 99 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SORT1Q99523 831 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DRC3Q9H069 523 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CERS4Q9HA82 394 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TAS2R13Q9NYV9 303 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 OBSL1O75147 1896 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A0G2JND7 137 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 EPOPA6NHQ4 379 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 AGAP14A8MT82 685 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 F8W8V4 182 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ITM2AO43736 263 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DLX3O60479 287 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NPHS1O60500 1241 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ESR1P03372 595 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PYGLP06737 847 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ALPIP09923 528 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC166P0CW27 439 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CTPS1P17812 591 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GKP32189 559 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 VIPR2P41587 438 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SCTRP47872 440 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 DGKGP49619 791 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ATP6V0D1P61421 351 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 NFKB2Q00653 900 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CSHL1Q14406 222 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GEN1Q17RS7 908 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GPR33Q49SQ1 333 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SNX20Q7Z614 316 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 PIANPQ8IYJ0 282 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 RHEBL1Q8TAI7 183 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 KCNJ9Q92806 393 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 BIRC8Q96P09 236 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC1Q99614 292 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 WWP1Q9H0M0 922 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 MYLK2Q9H1R3 596 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 P2RY12Q9H244 342 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 SAR1AQ9NR31 198 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC1-201ENST00000229304 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms