RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 BRD7Q9NPI1 651 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SETD4Q9NVD3 440 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HEY2Q9UBP5 337 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SRRDQ9UH36 339 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SERTAD1Q9UHV2 236 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MGAT4BQ9UQ53 548 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 NR2E1Q9Y466 385 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FKBP7Q9Y680 259 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CLIC4Q9Y696 253 aa6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 A0A1B0GUL6 1792 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FLT4P35916 1363 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 A0A1W2PPW3 197 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CARNS1A5YM72 827 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CCDC182A6NF36 153 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 POM121CA8CG34 1229 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KCNK1O00180 336 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MEN1O00255 615 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CTDSP2O14595 271 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FZD6O60353 706 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 JAK2O60674 1132 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 IL18RAPO95256 599 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RAB3DO95716 219 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DLGAP3O95886 979 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 BMP15O95972 392 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FGGP02679 453 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SBK2P0C263 348 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CYP2D6P10635 497 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PRPS2P11908 318 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PRF1P14222 555 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DDCP20711 480 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 GDI1P31150 447 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CXCR5P32302 372 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 GPC1P35052 558 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 BMI1P35226 326 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PRKCIP41743 596 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC1A4P43007 532 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HTR3AP46098 478 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 MAP2K3P46734 347 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CAPZA1P52907 286 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SEC13P55735 322 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 GPX6P59796 221 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ERVK-8P63133 956 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 RBP5P82980 135 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 GNA12Q03113 381 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF91Q05481 1191 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FOXO1Q12778 655 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 POU4F2Q12837 409 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PAK1Q13153 545 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 NFYCQ13952 458 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ZMYND11Q15326 602 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DLGAP5Q15398 846 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 HGSNATQ68CP4 663 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 TMEM65Q6PI78 240 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 NT5DC3Q86UY8 548 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 KRT73Q86Y46 540 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 PHC2Q8IXK0 858 aa6.19□□□□□ -1.42
SAMMSON-210ENST00000641260 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.19□□□□□ -1.42
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