RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638939.1

PDE4D-229, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-229ENST00000638939 SOX5P35711 763 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 STAT1P42224 750 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 GPR3P46089 330 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TPI1P60174 286 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 AP1S1P61966 158 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 PEX6Q13608 980 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 ARHGEF7Q14155 803 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CYTH1Q15438 398 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TCEA2Q15560 299 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CAMK4Q16566 473 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TBR1Q16650 682 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 PHF19Q5T6S3 580 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 AFMIDQ63HM1 303 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 DNAJC24Q6P3W2 148 aa5.5□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 VASH2Q86V25 355 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 PYROXD2Q8N2H3 581 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 PLA2G15Q8NCC3 412 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 FAM46DQ8NEK8 389 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 SLC30A5Q8TAD4 765 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 HTR3CQ8WXA8 447 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 USP7Q93009 1102 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CNPY3Q9BT09 278 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 DDA1Q9BW61 102 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TRIM4Q9C037 500 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CLSTN2Q9H4D0 955 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 ADAM22Q9P0K1 906 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 FZD10Q9ULW2 581 aa5.5□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 MED13Q9UHV7 2174 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 A0A1W2PQ67 120 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 FAM170AA1A519 330 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 A6NHS1 94 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 ARHGAP42A6NI28 874 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 SIGLEC16A6NMB1 481 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 J3KR12 359 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 PSMD11O00231 422 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 PES1O00541 588 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 EPHB6O15197 1021 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 NTRK1P04629 796 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 THRAP10827 490 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 KRT10P13645 584 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CCNB1P14635 433 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 TEAD1P28347 426 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 RGRP47804 291 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 MAPK10P53779 464 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 KCNAB2Q13303 367 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 SRLQ86TD4 932 aa5.49□□□□□ -1.53
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PDE4D-229ENST00000638939 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 NETO2Q8NC67 525 aa5.49□□□□□ -1.53
PDE4D-229ENST00000638939 CCDC112Q8NEF3 446 aa5.49□□□□□ -1.53
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