RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZVL8 140 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PSKH2Q96QS6 385 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PCSK1NQ9UHG2 260 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa27.26■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMA2P25787 234 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 OAS2P29728 719 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 OGDHQ02218 1023 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NPWQ8N729 165 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 FNIP1Q8TF40 1166 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD8Q92502 1023 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CLSTN2Q9H4D0 955 aa27.25■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 SOCS5O75159 536 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K6O95382 1288 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 LHCGRP22888 699 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK9P45984 424 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MC1RQ01726 317 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC10A7Q0GE19 358 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 BMPERQ8N8U9 685 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC37A2Q8TED4 501 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 AGPAT1Q99943 283 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CD84Q9UIB8 345 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PHTF1Q9UMS5 762 aa27.24■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 BLACEA4D250 179 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TCN2P20062 427 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TEAD1P28347 426 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MC2RQ01718 297 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf17Q53FE4 359 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ERMARDQ5T6L9 678 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN33Q86UF1 283 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM74Q86UV6 250 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ATCAYQ86WG3 371 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT13Q8IUC8 556 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NCSTNQ92542 709 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL3Q9UH77 587 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC18AA5D8T8 446 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR19A6NJB7 356 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMD11O00231 422 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 STK17BO94768 372 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD18Q0P651 414 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NFATC2Q13469 925 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT31Q15323 416 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC18BQ6UXF7 455 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 USP45Q70EL2 814 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MCOLN2Q8IZK6 566 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 LZTR1Q8N653 840 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC18CQ8NCF0 446 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NEK11Q8NG66 645 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF599Q96NL3 588 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDCD1Q96RS6 583 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 ZPBPQ9BS86 351 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NOD2Q9HC29 1040 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 NBASA2RRP1 2371 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 CTPS1P17812 591 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 FASLGP48023 281 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 COPB1P53618 953 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRB1Q12918 225 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAF2Q12933 501 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRRQ15256 657 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TP53INP2Q8IXH6 220 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 BBS5Q8N3I7 341 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 AP2M1Q96CW1 435 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PEBP4Q96S96 227 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 APMAPQ9HDC9 416 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 PDP2Q9P2J9 529 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-217ENST00000629983 MTSS1O43312 755 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PRPSAP2O60256 369 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ASMTLO95671 621 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 HHEXQ03014 270 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SFRP1Q8N474 314 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SPOCK2Q92563 424 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SIK3Q9Y2K2 1263 aa27.2■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0U1RQS6 177 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 NR1D1P20393 614 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFAIP3P21580 790 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 MAXP61244 160 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 LRP8Q14114 963 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 PYCR3Q53H96 274 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC12Q5T9G4 340 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ACAD10Q6JQN1 1059 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 RFLNAQ6ZTI6 216 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SCRN2Q96FV2 425 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-217ENST00000629983 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
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