RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615065.1

PRKN-211, Transcript of parkin RBR E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRKN, Length 261 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKN-211ENST00000615065 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TRIM74Q86UV6 250 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PATE1Q8WXA2 126 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 RAPGEF5Q92565 580 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SCAMP4Q969E2 229 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 FATE1Q969F0 183 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 AP2M1Q96CW1 435 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 DNAJC7Q99615 494 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 KALRNO60229 2985 aa14.77□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CAPN8A6NHC0 703 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TPM3P06753 285 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 IVLP07476 585 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TMEM253P0C7T8 217 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ZNF30P17039 623 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SLC5A2P31639 672 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 MAN1A1P33908 653 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ADCY8P40145 1251 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 STC1P52823 247 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 B4GALNT1Q00973 533 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CTBSQ01459 385 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CLN3Q13286 438 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 JAMLQ86YT9 394 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 OR8K1Q8NGG5 319 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 HDAC11Q96DB2 347 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 AGAP2Q99490 1192 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 DEF6Q9H4E7 631 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 DTLQ9NZJ0 730 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PISDQ9UG56 409 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 AMACRQ9UHK6 382 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.76□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 B4GAT1O43505 415 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CLDN7O95471 211 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ECEL1O95672 775 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 JMJD7P0C870 316 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ITIH1P19827 911 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 MX2P20592 715 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CES1P23141 567 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 KDELR1P24390 212 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 OR1D5P58170 312 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 VAC14Q08AM6 782 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 TRIM14Q14142 442 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 MESDQ14696 234 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 AMZ1Q400G9 498 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 MAP9Q49MG5 647 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 NAGSQ8N159 534 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CCNYQ8ND76 341 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 RNF157Q96PX1 679 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 OR2M4Q96R27 311 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 RDH14Q9HBH5 336 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 LRRD1A4D1F6 860 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ERVH48-1M5A8F1 160 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 KCNK1O00180 336 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 INPP4BO15327 924 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 AKR1B10O60218 316 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 JCHAINP01591 159 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 MMP2P08253 660 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PTMSP20962 102 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CA4P22748 312 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ALDH4A1P30038 563 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ETV5P41161 510 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ACTR1BP42025 376 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 CD86P42081 329 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ACTR1AP61163 376 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 ZBTB17Q13105 803 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 NR1D2Q14995 579 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PHF19Q5T6S3 580 aa14.74□□□□□ -0.05
PRKN-211ENST00000615065 PLD5Q8N7P1 536 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms