RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591417.5

HKR1-222, Transcript of HKR1, GLI-Kruppel zinc finger family member, human

TSL 4 BASIC

Gene HKR1, Length 525 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HKR1-222	ENST00000591417	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.36	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	LOC101059948	A0A1B0GTJ6	334 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417		A8MU76	341 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	RNF8	O76064	485 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	FUCA1	P04066	466 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	CCDC172	P0C7W6	258 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	SLC2A4	P14672	509 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	ERCC2	P18074	760 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	ETV3	P41162	512 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	FASLG	P48023	281 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	POLD2	P49005	469 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	JAM2	P57087	298 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	DPT	Q07507	201 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	LRP8	Q14114	963 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.35	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	PRR19	A6NJB7	356 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	STK17B	O94768	372 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	CSF2RB	P32927	897 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	HCAR3	P49019	387 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	RFX8	Q6ZV50	586 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417		Q6ZVL8	140 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	USP45	Q70EL2	814 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	MON1B	Q7L1V2	547 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	ESX1	Q8N693	406 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	STARD8	Q92502	1023 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	NCSTN	Q92542	709 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	SCRN2	Q96FV2	425 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	CTRC	Q99895	268 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
HKR1-222	ENST00000591417	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	BLACE	A4D250	179 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	INPP4B	O15327	924 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PRPSAP2	O60256	369 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ASMTL	O95671	621 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PSMA2	P25787	234 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	HHEX	Q03014	270 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	MAP7	Q14244	749 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PYCR3	Q53H96	274 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	NLRP8	Q86W28	1048 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	SFRP1	Q8N474	314 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	MIB2	Q96AX9	1013 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ZWILCH	Q9H900	591 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PARVA	Q9NVD7	372 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PLAA	Q9Y263	795 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		11.33	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	OR5K4	A6NMS3	321 aa		11.32	□□□□□ -0.6
HKR1-222	ENST00000591417	VPS4B	O75351	444 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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