RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF852Q6ZMS4 543 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 THEGQ9P2T0 379 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPM1 405 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 S1PR4O95977 384 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXB2P14652 356 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 BPIP17213 487 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT4P19013 534 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GABRB3P28472 473 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD8P48556 350 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TTPAP49638 278 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CLCN5P51795 746 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MPP1Q00013 466 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 BMPR2Q13873 1038 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 EOGTQ5NDL2 527 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 IER5LQ5T953 404 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CERS6Q6ZMG9 384 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa30.95■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 AREL1O15033 823 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SRP72O76094 671 aaKnown RBP30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 C1SP09871 688 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PMLP29590 882 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINT3P49223 89 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 DCDC1P59894 354 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC18A2Q05940 514 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RALGDSQ12967 914 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 POM121L1PQ3SYA9 428 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR33Q49SQ1 333 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SNX20Q7Z614 316 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CABS1Q96KC9 395 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC1Q99614 292 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SCML1Q9UN30 329 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0U1RQS6 177 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 A8MX80 341 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.545e-9■□□□□ 8.4
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAM23O75077 832 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RFPL1O75677 317 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGALP20701 1170 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINB8P50452 374 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC73Q5JTD7 316 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SYNPOQ8N3V7 929 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 IL26Q9NPH9 171 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM6Q9NQX0 595 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT16Q9UBV4 365 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf67A6NJJ6 358 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 HAUS5O94927 633 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNFP41002 786 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 COPAP53621 1224 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 LIPIQ6XZB0 460 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D5Q6ZV89 423 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 DCLK2Q8N568 766 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SERAC1Q96JX3 654 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MKS1Q9NXB0 559 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 AP1G1O43747 822 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAMEF1O95521 474 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ELFN1P0C7U0 828 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEA12P43365 314 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB16Q05516 673 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM52BQ4KMG9 183 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NRSN1Q8IZ57 195 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SHDQ96IW2 340 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ARHGEF3Q9NR81 526 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TRPM6Q9BX84 2022 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQF6 199 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 AGAP14A8MT82 685 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXO6A8MYZ6 492 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY2P41231 377 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 METAP1P53582 386 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS14P62263 151 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 POU4F1Q01851 419 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGA9Q13797 1035 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf33Q8N1A6 199 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR26Q8NDV2 337 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SELENOSQ9BQE4 189 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP17Q9ULZ9 603 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 UNC80Q8N2C7 3258 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 A6NNZ2 444 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFS3O75489 264 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 PYGBP11216 843 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CREB1P16220 341 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 TYK2P29597 1187 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 DRD3P35462 400 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMG2Q02383 582 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 CNTN1Q12860 1018 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-206ENST00000588815 NFATC2Q13469 925 aa30.89■■■□□ 2.54
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