RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570156.6

OBSCN-210, Transcript of obscurin, cytoskeletal calmodulin and titin-interacting RhoGEF, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene OBSCN, Length 26,925 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCN-210ENST00000570156 FBXO39Q8N4B4 442 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CANT1Q8WVQ1 401 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZSWIM3Q96MP5 696 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ATP8B3O60423 1300 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 DGKAP23743 735 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CLCN3P51790 818 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PGGT1BP53609 377 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 RAB6CQ53S08 254 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 TP53INP1Q96A56 240 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PLK2Q9NYY3 685 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 RAB23Q9ULC3 237 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 NUDT7P0C024 238 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 F8A1P23610 371 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ADCYAP1R1P41586 468 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PAQR3Q6TCH7 311 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SLCO6A1Q86UG4 719 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 EHD3Q9NZN3 535 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 LRCH4O75427 683 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CYP4F8P98187 520 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CCDC157Q569K6 752 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 MNTQ99583 582 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SGTAO43765 313 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 HOXC6P09630 235 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 GGT5P36269 586 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 IKBKEQ14164 716 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 NODALQ96S42 347 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZNF536O15090 1300 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 TPST1O60507 370 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 EFHBQ8N7U6 833 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ADAM2Q99965 735 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ANKHQ9HCJ1 492 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PXDNLA1KZ92 1463 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 C7orf72A4D263 438 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PER2O15055 1255 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 GLRA3O75311 464 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 GRIK4Q16099 956 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 EXT2Q93063 718 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZNF560Q96MR9 790 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ADPRHL2Q9NX46 363 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 HALP42357 657 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 TIPRLO75663 272 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 GOT1P17174 413 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 NUDT2P50583 147 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 BNIP2Q12982 314 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SQLEQ14534 574 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 TRIQKQ629K1 86 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 NPY6RQ99463 290 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 KIFC1Q9BW19 673 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PHF11Q9UIL8 331 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ABCG2Q9UNQ0 655 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 TMEM114B3SHH9 223 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 KPNA5O15131 536 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 MATN3O15232 486 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 ARIH2O95376 493 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 YWHAQP27348 245 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 SLC11A2P49281 568 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 NSMCE2Q96MF7 247 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 OR52B2Q96RD2 323 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 OR52E6Q96RD3 313 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.95□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.94□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 FBP2O00757 339 aa4.94□□□□□ -1.62
OBSCN-210ENST00000570156 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms