RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563295.1

KIFC3-215, Transcript of kinesin family member C3, humanhuman

TSL 5

Gene KIFC3, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3-215ENST00000563295 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 KIAA1328Q86T90 577 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 TXLNBQ8N3L3 684 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 KYQ8NBH2 561 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 WDR48Q8TAF3 677 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 KRT35Q92764 455 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 SCAMP4Q969E2 229 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 TEKT5Q96M29 485 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 TRIB3Q96RU7 358 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 GLOD4Q9HC38 313 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CD84Q9UIB8 345 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 AK5Q9Y6K8 562 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.91□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CCDC66A2RUB6 948 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 HACD1B0YJ81 288 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 PJA2O43164 708 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CSO75390 466 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 TCEA3O75764 348 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CETN2P41208 172 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 GNPDA1P46926 289 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 SPINT3P49223 89 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 ADCY2Q08462 1091 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 XRCC4Q13426 336 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 PEX6Q13608 980 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 PERM1Q5SV97 790 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CCDC181Q5TID7 509 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 OGFOD3Q6PK18 319 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 BBS12Q6ZW61 710 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 ACRBPQ8NEB7 543 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 GPR156Q8NFN8 814 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 TADA1Q96BN2 335 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 HIC2Q96JB3 615 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 VAT1Q99536 393 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 HEMGNQ9BXL5 484 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 CDH19Q9H159 772 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 MAGEE1Q9HCI5 957 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 RAD18Q9NS91 495 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 SUFUQ9UMX1 484 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 RAXQ9Y2V3 346 aa9.9□□□□□ -0.82
KIFC3-215ENST00000563295 LAMA5O15230 3695 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 USP12O75317 370 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 PMPCBO75439 489 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 NDST3O95803 873 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 SOD1P00441 154 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 EPOP01588 193 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 APOC2P02655 101 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 FUCA1P04066 466 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 IVLP07476 585 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 GLB1P16278 677 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 CTNNA2P26232 953 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 PTPN7P35236 360 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 POLD2P49005 469 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 RWDD2BP57060 319 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 WASHC5Q12768 1159 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 KIF5AQ12840 1032 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 SPIDRQ14159 915 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 GALNT3Q14435 633 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 PCSK7Q16549 785 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 ISXQ2M1V0 245 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 FAM182AQ5T1J6 154 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 DOK6Q6PKX4 331 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 LRRC57Q8N9N7 239 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 SPC24Q8NBT2 197 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.89□□□□□ -0.83
KIFC3-215ENST00000563295 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms