RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	APOD	P05090	189 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	BPGM	P07738	259 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF30	P17039	623 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ITGAL	P20701	1170 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SPAM1	P38567	509 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SLC26A3	P40879	764 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	IRF9	Q00978	393 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	HTR4	Q13639	388 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF234	Q14588	700 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	LRRC66	Q68CR7	880 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	LPGAT1	Q92604	370 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736		A0A0U1RQS6	177 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PRAMEF1	O95521	474 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	CTSL	P07711	333 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ARHGEF7	Q14155	803 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ZSCAN26	Q16670	478 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ATG16L1	Q676U5	607 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	C16orf46	Q6P387	395 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	SNX20	Q7Z614	316 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF366	Q8N895	744 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	TMIE	Q8NEW7	156 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	OLFM1	Q99784	485 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM245	Q9H330	911 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	MTG2	Q9H4K7	406 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	GPAM	Q9HCL2	828 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		18.15	■□□□□ 0.5
MEG3-227	ENST00000556736	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	KLHL2	O95198	593 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	BMP1	P13497	986 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	BPI	P17213	487 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	VIPR1	P32241	457 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	PTGER3	P43115	390 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	GPR33	Q49SQ1	333 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	RDH11	Q8TC12	318 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	IL26	Q9NPH9	171 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	SUN2	Q9UH99	717 aa		18.14	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	NPC1	O15118	1278 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	PRSS56	P0CW18	603 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	FDXR	P22570	491 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	LHCGR	P22888	699 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	IRX4	P78413	519 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	NFATC2	Q13469	925 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	CHFR	Q96EP1	664 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	ASB8	Q9H765	288 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF358	Q9NW07	568 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	COPG2	Q9UBF2	871 aa		18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	18.13	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736		A8MX80	341 aa		18.12	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	18.12	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	18.12	■□□□□ 0.49
MEG3-227	ENST00000556736	HLA-E	P13747	358 aa		18.12	■□□□□ 0.49

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