RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541157.5

MRE11-210, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, human

TSL 4

Gene MRE11, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRE11-210	ENST00000541157	SLC18A1	P54219	525 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	TMPRSS15	P98073	1019 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MPP1	Q00013	466 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SLC18A2	Q05940	514 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CTBP1	Q13363	440 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ENPP2	Q13822	863 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MPP2	Q14168	576 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	BANP	Q8N9N5	519 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	TMIE	Q8NEW7	156 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	OR4L1	Q8NH43	312 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ISL2	Q96A47	359 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	EID2B	Q96D98	161 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	APOPT1	Q96IL0	206 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	VPS39	Q96JC1	886 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	GPR22	Q99680	433 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	KCNK12	Q9HB15	430 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MKS1	Q9NXB0	559 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	IL17C	Q9P0M4	197 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	PKP3	Q9Y446	797 aa		10	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157		A0A0U1RQS6	177 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	OR51F1	A6NGY5	319 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	GOLGA8R	I6L899	631 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	TPP1	O14773	563 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SPAG7	O75391	227 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	AHSG	P02765	367 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CHN1	P15882	459 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	IL12RB1	P42701	662 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MAGEA12	P43365	314 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ABCG1	P45844	678 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CD151	P48509	253 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SERPINB8	P50452	374 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	STK40	Q8N2I9	435 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	DCLK2	Q8N568	766 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MDM1	Q8TC05	714 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	FAM129B	Q96TA1	746 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ACOX2	Q99424	681 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SUN2	Q9UH99	717 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157		A6NNZ2	444 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157		K7EQS6	105 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	CLDN7	O95471	211 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	LHCGR	P22888	699 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	NFKBIA	P25963	317 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	ITGB7	P26010	798 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	VIPR1	P32241	457 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	MC4R	P32245	332 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	FOXN2	P32314	431 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRE11-210	ENST00000541157	POLD2	P49005	469 aa		9.98	□□□□□ -0.81

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms