RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520903.1

RNF19A-208, Transcript of ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene RNF19A, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF19A-208	ENST00000520903	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	RAB23	Q9ULC3	237 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	LNP1	A1A4G5	178 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	BICDL2	A1A5D9	508 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM227A	F5H4B4	570 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	NPC1	O15118	1278 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ARHGAP6	O43182	974 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TRIM13	O60858	407 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	PEX14	O75381	377 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TOX4	O94842	621 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	RHOBTB1	O94844	696 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ENDOD1	O94919	500 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	CAVIN2	O95810	425 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	LATS1	O95835	1130 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	IGLV3-19	P01714	112 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	IGLV3-25	P01717	112 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	FPR1	P21462	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	PON1	P27169	355 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ECHS1	P30084	290 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	HLA-F	P30511	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	SLC6A4	P31645	630 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	CRHR1	P34998	444 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	MPL	P40238	635 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	IL12RB1	P42701	662 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	PTGER3	P43115	390 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	RGS7	P49802	495 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	SGSH	P51688	502 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	SLURP1	P55000	103 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	APBA1	Q02410	837 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TLE1	Q04724	770 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	KDSR	Q06136	332 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ADIG	Q0VDE8	80 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	EFEMP1	Q12805	493 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	DUSP8	Q13202	625 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	MTM1	Q13496	603 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	STIM1	Q13586	685 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	SEMA5A	Q13591	1074 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	LLGL1	Q15334	1064 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	CCDC6	Q16204	474 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	CAMK4	Q16566	473 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	VMAC	Q2NL98	169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	GAGE13	Q4V321	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	MIIP	Q5JXC2	388 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	EOGT	Q5NDL2	527 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	MPP7	Q5T2T1	576 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	STPG1	Q5TH74	334 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ANO7	Q6IWH7	933 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	GJB7	Q6PEY0	223 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	USP30	Q70CQ3	517 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	PIP4P1	Q86T03	277 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TTC7B	Q86TV6	843 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	MLKL	Q8NB16	471 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	NT5C3B	Q969T7	300 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	TTC17	Q96AE7	1141 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	RGMA	Q96B86	450 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	NT5C1B	Q96P26	610 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RNF19A-208	ENST00000520903	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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