RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497715.1

CUL3-212, Transcript of cullin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CUL3, Length 2,400 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3-212ENST00000497715 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 NIT2Q9NQR4 276 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ARHGEF4Q9NR80 690 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 GJD2Q9UKL4 321 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 PPT2Q9UMR5 302 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 USP18Q9UMW8 372 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 CPQQ9Y646 472 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 DAPK1P53355 1430 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 NUP160Q12769 1436 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 RTL9Q8NET4 1388 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 JCADQ9P266 1359 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 SHANK2Q9UPX8 1470 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 NPHP3Q7Z494 1330 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 HACD1B0YJ81 288 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 TGM6O95932 706 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ALDH1A1P00352 501 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 OPN1LWP04000 364 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 HRGP04196 525 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ADRB3P13945 408 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 CCDC130P13994 396 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 PAMP19021 973 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 TMPOP42166 694 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MCAMP43121 646 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 GRK6P43250 576 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 OMPP47874 163 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ID4P47928 161 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 RAB13P51153 203 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 CDH13P55290 713 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ACTBP60709 375 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ACTG1P63261 375 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ACTG2P63267 376 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ACTC1P68032 377 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ACTA1P68133 377 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 DSG1Q02413 1049 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MBTD1Q05BQ5 628 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 DNASE1L3Q13609 305 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 GCKRQ14397 625 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ZNF273Q14593 569 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 DLG2Q15700 870 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 C6orf10Q5SRN2 563 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 LPCAT4Q643R3 524 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 SPESP1Q6UW49 350 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 NEK8Q86SG6 692 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 CUZD1Q86UP6 607 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MICU3Q86XE3 530 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 PYROXD2Q8N2H3 581 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 KDM1BQ8NB78 822 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 DENND6BQ8NEG7 585 aa5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ST8SIA4Q92187 359 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 TFAP2BQ92481 460 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MTERF3Q96E29 417 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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CUL3-212ENST00000497715 LRRC1Q9BTT6 524 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 PCDH9Q9HC56 1237 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 TJP2Q9UDY2 1190 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 NARFQ9UHQ1 456 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 SAR1BQ9Y6B6 198 aa5.05□□□□□ -1.6
CUL3-212ENST00000497715 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.05□□□□□ -1.6
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