RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 NFKB2Q00653 900 aa6.52□□□□□ -1.37
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-210ENST00000489741 SHC3Q92529 594 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRPF40A-210ENST00000489741 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT8Q9NY28 637 aa6.51□□□□□ -1.37
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