RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489352.5

HDAC6-233, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 4

Gene HDAC6, Length 585 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TGM7	Q96PF1	710 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		11.45	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	E2F3	O00716	465 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	BUB1	O43683	1085 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	GRAP2	O75791	330 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	GLI1	P08151	1106 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FOSL1	P15407	271 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	AMD1	P17707	334 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	MMP12	P39900	470 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	GPD2	P43304	727 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	GFER	P55789	205 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CDC16	Q13042	620 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	STK4	Q13043	487 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	GRM3	Q14832	879 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	E2F4	Q16254	413 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352		Q6ZS92	163 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	C1orf74	Q96LT6	269 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		11.44	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ATR	Q13535	2644 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	HSF2BP	O75031	334 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	PIGN	O95427	931 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FUCA1	P04066	466 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC2A4	P14672	509 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ACVRL1	P37023	503 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	POLD2	P49005	469 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	SMS	P52788	366 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	MYBPC3	Q14896	1274 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FCRL6	Q6DN72	434 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	DOK6	Q6PKX4	331 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	STK32A	Q8WU08	396 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.43	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	MED7	O43513	233 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TMCC1	O94876	653 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TIAF1	O95411	115 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CALCA	P01258	141 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	IVL	P07476	585 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TYRP1	P17643	537 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	PBX1	P40424	430 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TUBB3	Q13509	450 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CUL4B	Q13620	913 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ATP1A4	Q13733	1029 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	LIPI	Q6XZB0	460 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	RAB43	Q86YS6	212 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	GALNT16	Q8N428	558 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	NUS1	Q96E22	293 aa		11.42	□□□□□ -0.58
HDAC6-233	ENST00000489352	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		11.42	□□□□□ -0.58

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