RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RENBPP51606 427 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 OR1D5P58170 312 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZNF662Q6ZS27 426 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 Q6ZVL8 140 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CPNE8Q86YQ8 564 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 LZTR1Q8N653 840 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 OR6C4Q8NGE1 309 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 LRRN4Q8WUT4 740 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TMEM74Q96NL1 305 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MGME1Q9BQP7 344 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 STRADBQ9C0K7 418 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SEMA6CQ9H3T2 930 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 RDH14Q9HBH5 336 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PCDH18Q9HCL0 1135 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CD84Q9UIB8 345 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 APPL1Q9UKG1 709 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 LOXL2Q9Y4K0 774 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 DUSP10Q9Y6W6 482 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 COL6A6A6NMZ7 2263 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.62□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 BTNL10A8MVZ5 291 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PRAMEF10O60809 474 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SOCS5O75159 536 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MAP3K6O95382 1288 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 FGF1P05230 155 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PDHA1P08559 390 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CD48P09326 243 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CCNB1P14635 433 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 KELP23276 732 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 GNPDA1P46926 289 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MAPK10P53779 464 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 B4GALNT1Q00973 533 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF7Q14155 803 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 IHHQ14623 411 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 AMZ1Q400G9 498 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PHF19Q5T6S3 580 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SLITRK4Q8IW52 837 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TXLNBQ8N3L3 684 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ATPAF2Q8N5M1 289 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 GPBAR1Q8TDU6 330 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TRIM11Q96F44 468 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 DTD2Q96FN9 168 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TEX101Q9BY14 249 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 NT5MQ9NPB1 228 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 FOXJ2Q9P0K8 574 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TAAR2Q9P1P5 351 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SUFUQ9UMX1 484 aa12.61□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PGLSO95336 258 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ECEL1O95672 775 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MYBL1P10243 752 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 IL4RP24394 825 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 MMP13P45452 471 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 CDK3Q00526 305 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 KIF5AQ12840 1032 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 C16orf72Q14CZ0 275 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TCEAL1Q15170 157 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 BOLA3Q53S33 107 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 FAM182AQ5T1J6 154 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 RAET1GQ6H3X3 334 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 DOK6Q6PKX4 331 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SLC30A9Q6PML9 568 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 USP53Q70EK8 1073 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TRIM74Q86UV6 250 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 VASH2Q86V25 355 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ZFAND4Q86XD8 727 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 RCBTB1Q8NDN9 531 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PIH1D2Q8WWB5 315 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 SPOCK2Q92563 424 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 USP7Q93009 1102 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 WBP1Q96G27 269 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 NUDT22Q9BRQ3 303 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 LZTFL1Q9NQ48 299 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ANAPC7Q9UJX3 599 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PHTF1Q9UMS5 762 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 GUCA1BQ9UMX6 200 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa12.6□□□□□ -0.39
PRAME-212ENST00000485532 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms