RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 GBE1Q04446 702 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 AMZ1Q400G9 498 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 MAP9Q49MG5 647 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PHF19Q5T6S3 580 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ZNF670Q9BS34 389 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 RDH14Q9HBH5 336 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.49■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 A0A0J9YYE9 177 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ERVH48-1M5A8F1 160 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ECEL1O95672 775 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TRBC1P01850 177 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 HLA-DQB2P05538 268 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 KRT10P13645 584 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PNLIPP16233 465 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ADCY8P40145 1251 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 OR1D5P58170 312 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 B4GALNT1Q00973 533 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PQLC3Q8N755 202 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 AGAP2Q99490 1192 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 SSUH2Q9Y2M2 353 aa21.48■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 RHPN2P1A8MT19 583 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 INPP4BO15327 924 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 B4GAT1O43505 415 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 H2AFZP0C0S5 128 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TEAD1P28347 426 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ALDH4A1P30038 563 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ETV5P41161 510 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 RHDQ02161 417 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PTSQ03393 145 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 DPTQ07507 201 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 NIPAL4Q0D2K0 466 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PDK2Q15119 407 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TGIF1Q15583 401 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 H2AFVQ71UI9 128 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 SLITRK4Q8IW52 837 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ARRDC2Q8TBH0 407 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 SEMA6CQ9H3T2 930 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 CAPN8A6NHC0 703 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 PRLP01236 227 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 IVLP07476 585 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 CCNCP24863 283 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ACTR1BP42025 376 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 STC1P52823 247 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 MAPK10P53779 464 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ACTR1AP61163 376 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 CFHR1Q03591 330 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 BIRC2Q13490 618 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 SLC18A3Q16572 532 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 CCDC81Q6ZN84 652 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 USP53Q70EK8 1073 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 NAGSQ8N159 534 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 ZNF843Q8N446 348 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 CCNYQ8ND76 341 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 RAPGEF5Q92565 580 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 FAF2Q96CS3 445 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 TSGA13Q96PP4 275 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 OR2M4Q96R27 311 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 CDH19Q9H159 772 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 DEF6Q9H4E7 631 aa21.46■■□□□ 1.03
USP40-215ENST00000484528 K7ENP7 123 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 CLDN7O95471 211 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 CPNE6O95741 557 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 KRT7P08729 469 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 ZNF30P17039 623 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 LY6DQ14210 128 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 MESDQ14696 234 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 PCDH9Q9HC56 1237 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 DTLQ9NZJ0 730 aa21.45■■□□□ 1.02
USP40-215ENST00000484528 SDK2Q58EX2 2172 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms