RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 IPMKQ8NFU5 416 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TRIM58Q8NG06 486 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CCDC110Q8TBZ0 833 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SPATA13Q96N96 652 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TLR10Q9BXR5 811 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CARD9Q9H257 536 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ZNF711Q9Y462 761 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 RGSL1A5PLK6 1076 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 C5orf60A6NFR6 353 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TPP1O14773 563 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TNFP01375 233 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PSMB4P28070 264 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CHRNA4P43681 627 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 HS1BP3Q53T59 392 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 APOLD1Q96LR9 279 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 U3KQA8 63 aa20.87■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 LMO7DNF2Z398 122 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 AURKAO14965 403 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 YY2O15391 372 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ANXA9O76027 345 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FUCA1P04066 466 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM5P06731 702 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PYGLP06737 847 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ACP1P24666 158 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GEMP55040 296 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SLC1A5Q15758 541 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CCDC157Q569K6 752 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 RFPL3O75679 317 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 AGTP01019 485 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CKMT1AP12532 417 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 MYF5P13349 255 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CTSEP14091 401 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 HLA-DPA1P20036 260 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ADRA1AP35348 466 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GDF10P55107 478 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ELOCQ15369 112 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 REXO1L1PQ8IX06 675 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FAM71DQ8N9W8 422 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 KLK13Q9UKR3 277 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PRSS38A1L453 326 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ANXA6P08133 673 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 POLD2P49005 469 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 DAB2P98082 770 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 PRPSAP1Q14558 356 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TCEA2Q15560 299 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 DHRS13Q6UX07 377 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 RANBP10Q6VN20 620 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 GPR26Q8NDV2 337 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 COX14Q96I36 57 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 HIC2Q96JB3 615 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FICDQ9BVA6 458 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 BOCQ9BWV1 1114 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TRABDQ9H4I3 376 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 LRP4O75096 1905 aa20.84■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 LIASO43766 372 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 FGF1P05230 155 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 ILKQ13418 452 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 OLIG2Q13516 323 aa20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
ACTB-211ENST00000480301 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
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