RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	PLEKHA2	Q9HB19	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	SIPA1L1	O43166	1804 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKD3-208	ENST00000475912	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM247	A6NEH6	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	DCX	O43602	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	DDAH2	O95865	285 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	ASNS	P08243	561 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	FOXO1	Q12778	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	FSCB	Q5H9T9	825 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	GOLGA1	Q92805	767 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	LDB2	O43679	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CD4	P01730	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CSF1	P09603	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	GRK6	P43250	576 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CLCNKB	P51801	687 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CCL23	P55773	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	DSCR9	P59020	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	MECOM	Q03112	1051 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	KEAP1	Q14145	624 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	HNF4G	Q14541	408 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	NFATC4	Q14934	902 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CCT6B	Q92526	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	RMI1	Q9H9A7	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	MYO9B	Q13459	2157 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	VWA5A	O00534	786 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	HSPB6	O14558	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	STRN	O43815	780 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CLDN7	O95471	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	GH2	P01242	217 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	PGK2	P07205	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	ARSA	P15289	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNA5	P22460	613 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PRKD3-208	ENST00000475912	ADORA1	P30542	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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