RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDKN3Q16667 212 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GRTP1Q5TC63 336 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERAP2Q6P179 960 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AFTPHQ6ULP2 937 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TLCD1Q96CP7 247 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MSANTD3Q96H12 275 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CD84Q9UIB8 345 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CKAP5Q14008 2032 aa6.4□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SHISA7A6NL88 538 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAN2B1O00754 1011 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HAUS5O94927 633 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRAMEF1O95521 474 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ELFN1P0C7U0 828 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADRB3P13945 408 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF30P17039 623 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BPIP17213 487 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KRT4P19013 534 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NR1D1P20393 614 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SAT1P21673 171 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNTFP26441 200 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GABRB3P28472 473 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MMP12P39900 470 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 P2RY2P41231 377 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NEK3P51956 506 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNTN1Q12860 1018 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PEX6Q13608 980 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCINQ13939 588 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SEMA3AQ14563 771 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FBXO43Q4G163 708 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNSTQ6PJW8 725 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RFLNAQ6ZTI6 216 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TRABD2AQ86V40 505 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FLCNQ8NFG4 579 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR2T3Q8NH03 318 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GANCQ8TET4 914 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MTBPQ96DY7 904 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VPS39Q96JC1 886 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMC6Q96SB8 1091 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RBBP8Q99708 897 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GABRG3Q99928 467 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa6.4□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A0C4DFX4 3053 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A1W2PP55 124 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A1W2PQF6 199 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HMX2A2RU54 273 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPAG7O75391 227 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADH1BP00325 375 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C1SP09871 688 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BRAFP15056 766 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C5AR1P21730 350 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FOXN2P32314 431 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPAM1P38567 509 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ETV3P41162 512 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CD151P48509 253 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPINT3P49223 89 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LIG3P49916 1009 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATP1A2P50993 1020 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 STC1P52823 247 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COPAP53621 1224 aa6.39□□□□□ -1.39
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LIMK2P53671 638 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms