RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 PROSER1Q86XN7 944 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 MDM1Q8TC05 714 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 SCAMP4Q969E2 229 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 TADA1Q96BN2 335 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 CYP4F3Q08477 520 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 TCEA2Q15560 299 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 PCSK7Q16549 785 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 HTR3CQ8WXA8 447 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 NXPE2Q96DL1 559 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 CACNA1BQ00975 2339 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 WDR48Q8TAF3 677 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 HAUS1Q96CS2 278 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPN4-208ENST00000460289 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPN4-208ENST00000460289 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPN4-208ENST00000460289 SPINT3P49223 89 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPN4-208ENST00000460289 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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PTPN4-208ENST00000460289 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF567Q8N184 647 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPN4-208ENST00000460289 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPN4-208ENST00000460289 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPN4-208ENST00000460289 FCRL5Q96RD9 977 aa22.87■■□□□ 1.25
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