RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PDP2	Q9P2J9	529 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF112	Q9ULX5	631 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		11.49	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SOBP	A7XYQ1	873 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MEI4	A8MW99	385 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758		E5RI56	91 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM38	O00635	465 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	AZIN1	O14977	448 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SNX2	O60749	519 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CYBB	P04839	570 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RGS4	P49798	205 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	APLP1	P51693	650 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RHOA	P61586	193 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	FOXM1	Q08050	763 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	FLOT2	Q14254	428 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GALNT3	Q14435	633 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MPPE1	Q53F39	396 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	AGR3	Q8TD06	166 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	C19orf60	Q96EN9	201 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SARDH	Q9UL12	918 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.48	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0D9SEW6	157 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SUPT3H	O75486	399 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	BAIAP3	O94812	1187 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	TMCC1	O94876	653 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MATN4	O95460	622 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	IGSF6	O95976	241 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	NPPA	P01160	153 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC4A1	P02730	911 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	IDO1	P14902	403 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CDC25C	P30307	473 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ARSD	P51689	593 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CDKN2D	P55273	166 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PKNOX1	P55347	436 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	MAP7	Q14244	749 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PTK2B	Q14289	1009 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GPNMB	Q14956	572 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR33	Q49SQ1	333 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	KBTBD6	Q86V97	674 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ASB9	Q96DX5	294 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SGF29	Q96ES7	293 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	B3GALT6	Q96L58	329 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		11.47	□□□□□ -0.57
TTLL3-222	ENST00000459758	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.47	□□□□□ -0.57

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