RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459482.1

SNORD11.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 11, humanhuman

BASIC

Gene SNORD11, Length 85 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD11.1-201ENST00000459482 SAAL1Q96ER3 474 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 KLHL1Q9NR64 748 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TMEM30AQ9NV96 361 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa4.58□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 UTYO14607 1347 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 NKX2-2O95096 273 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PBX3P40426 434 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 CASP6P55212 293 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 USP41Q3LFD5 358 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TSSK4Q6SA08 328 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 OR14L1PQ8NHC6 308 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PREBQ9HCU5 417 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 ASAH2Q9NR71 780 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 HAO1Q9UJM8 370 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa4.57□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 LINC01565O15544 149 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 HOXB5P09067 269 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 MT3P25713 68 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 MARK3P27448 753 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 CDONQ4KMG0 1287 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 GORABQ5T7V8 394 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 DPPA4Q7L190 304 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 IL17REQ8NFR9 667 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 OR5R1Q8NH85 324 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TBATAQ96M53 351 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 ACOX2Q99424 681 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 SH3GL2Q99962 352 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 ZFP57Q9NU63 452 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.56□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 A0A1W2PQF6 199 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 C1orf226A1L170 272 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 KCNK5O95279 499 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 CRYAAP02489 173 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 KRT10P13645 584 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 MCM3P25205 808 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 RAD23BP54727 409 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 F2RL1P55085 397 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PDE1BQ01064 536 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TROAPQ12815 778 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 SIGIRRQ6IA17 410 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 DSTYKQ6XUX3 929 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 NRROSQ86YC3 692 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TSPYL6Q8N831 410 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 NR4A3Q92570 626 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 WDFY2Q96P53 400 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 VPS33BQ9H267 617 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 A0A1W2PPH5 198 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PRR23AA6NEV1 266 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 ERVV-2B6SEH9 535 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 C16orf97H3BN30 126 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 KRT86O43790 486 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 PAGE4O60829 102 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 SP1P08047 785 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 DDX5P17844 614 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TAS2R38P59533 333 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 KRT81Q14533 505 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 KRT24Q2M2I5 525 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 GDPD4Q6W3E5 623 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD11.1-201ENST00000459482 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms