RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ELP6Q0PNE2 266 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FAM153CQ494X1 144 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MTX3Q5HYI7 312 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ALLCQ8N6M5 410 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 OR2L5Q8NG80 312 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ULBP1Q9BZM6 244 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 EURLQ9NYK6 297 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MYH7BA7E2Y1 1941 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C5orf60A6NFR6 353 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PSMD11O00231 422 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ADAMDEC1O15204 470 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AP5Z1O43299 807 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RGS10O43665 173 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CES3Q6UWW8 571 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 STRADAQ7RTN6 431 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CCDC115Q96NT0 180 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RNF157Q96PX1 679 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ABCG4Q9H172 646 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C2CD2Q9Y426 696 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PEX11AO75192 247 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 UBXN7O94888 489 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C22orf31O95567 290 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SERPINA3P01011 423 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IL1R1P14778 569 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AKT2P31751 481 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SSR2P43308 183 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IL18R1Q13478 541 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ACVR2BQ13705 512 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DET1Q7L5Y6 550 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TMEM17Q86X19 198 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CEP41Q9BYV8 373 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FANCFQ9NPI8 374 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.67□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 NRP2O60462 931 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TBL1XO60907 577 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 WFS1O76024 890 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DNTTP04053 509 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CYP17A1P05093 508 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ADORA2AP29274 412 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TEAD4Q15561 434 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FRRS1Q6ZNA5 592 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 OR4C6Q8NH72 309 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ADAM32Q8TC27 787 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GIPC3Q8TF64 312 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LRRC19Q9H756 370 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PRKCIP41743 596 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 DEF8Q6ZN54 512 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 ADAM2Q99965 735 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 IQGAP1P46940 1657 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 H0Y858 1186 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PDCD5O14737 125 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 FOLH1Q04609 750 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 LY6KQ17RY6 165 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 GPR107Q5VW38 600 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP46-201ENST00000441222 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms