RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428495.2

AL035665.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AL035665.1, Length 1,669 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AL035665.1-201ENST00000428495 INPP5AQ14642 412 aa6.86□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 LRRC14Q15048 493 aa6.86□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.86□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.86□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.86□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 TRIM59Q8IWR1 403 aa6.86□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.86□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.86□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.86□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 GOLGA6BA6NDN3 693 aa6.85□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.85□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.85□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 RRN3Q9NYV6 651 aa6.85□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 KLQ9UEF7 1012 aa6.85□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 B4DGG1 531 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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AL035665.1-201ENST00000428495 F9P00740 461 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 TNFP01375 233 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 KRT85P78386 507 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 ARHGEF7Q14155 803 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 AMZ1Q400G9 498 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 BNIPLQ7Z465 357 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.84□□□□□ -1.31
AL035665.1-201ENST00000428495 PIM3Q86V86 326 aa6.84□□□□□ -1.31
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