RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ATG4AQ8WYN0 398 aa21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA6BA6NDN3 693 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TPP1O14773 563 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 AURKAO14965 403 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANXA9O76027 345 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM16O95361 564 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ACADVLP49748 655 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GEMP55040 296 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDF10P55107 478 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC1A5Q15758 541 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM121Q9BTD3 319 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 DUSP23Q9BVJ7 150 aa21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.94■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 LMO7DNF2Z398 122 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 FUCA1P04066 466 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CEACAM5P06731 702 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALPPL2P10696 532 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CKMT2P17540 419 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 HLA-DPA1P20036 260 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ADRA1AP35348 466 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB133Q30KQ1 61 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM181AQ8N9Y4 354 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 APOLD1Q96LR9 279 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 U3KQA8 63 aa21.93■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR26Q8NDV2 337 aa21.92■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 DCDC1P59894 354 aa21.91■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 HS1BP3Q53T59 392 aa21.91■■□□□ 1.1
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IGHV3-20-201ENST00000390606 SCNM1Q9BWG6 230 aa21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRABDQ9H4I3 376 aa21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 RFPL3O75679 317 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 METTL18O95568 372 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC4A1P02730 911 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 ANXA6P08133 673 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 CKMT1AP12532 417 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 MYF5P13349 255 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 BPIP17213 487 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 HMGCLP35914 325 aa21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
IGHV3-20-201ENST00000390606 POLD2P49005 469 aa21.9■■□□□ 1.1
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