RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-201ENST00000344376 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-201ENST00000344376 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-201ENST00000344376 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-201ENST00000344376 AK5Q9Y6K8 562 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-201ENST00000344376 DUSP10Q9Y6W6 482 aa16.02■□□□□ 0.16
ATG4B-201ENST00000344376 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CACNA1BQ00975 2339 aa16.02■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 HACD1B0YJ81 288 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PJA2O43164 708 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CDK18Q07002 472 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 KIF5AQ12840 1032 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PEX6Q13608 980 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PCSK7Q16549 785 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 KCTD16Q68DU8 428 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 BBS12Q6ZW61 710 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SCAMP4Q969E2 229 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 VAT1Q99536 393 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GRPEL1Q9HAV7 217 aa16.01■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 KRT37O76014 449 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 APOC2P02655 101 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CEACAM5P06731 702 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CTNNA2P26232 953 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GNPDA1P46926 289 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 RWDD2BP57060 319 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 ADCY2Q08462 1091 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 DOK6Q6PKX4 331 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 KDELC2Q7Z4H8 507 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SYCE1Q8N0S2 351 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 HIC2Q96JB3 615 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 TRIB3Q96RU7 358 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC3Q9BQI4 270 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 RAD18Q9NS91 495 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SUFUQ9UMX1 484 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 B4DGG1 531 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CSO75390 466 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PMPCBO75439 489 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 TCEA3O75764 348 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 NDST3O95803 873 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 IVLP07476 585 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SPINT3P49223 89 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 XRCC4Q13426 336 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 RTP5Q14D33 572 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PERM1Q5SV97 790 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM139Q8IV31 216 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SPATA22Q8NHS9 363 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 HTR3CQ8WXA8 447 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 TADA1Q96BN2 335 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CDH19Q9H159 772 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 DPEP2Q9H4A9 486 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 FAM83DQ9H4H8 585 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 FAM153AQ9UHL3 310 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 AMFRQ9UKV5 643 aa16■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 LRP4O75096 1905 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GRID2IPA4D2P6 1211 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 H7C0C1 242 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 TAF4O00268 1085 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SOD1P00441 154 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PTMAP06454 111 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 NFKB1P19838 968 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PTPN7P35236 360 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 ATP5OP48047 213 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 WASHC5Q12768 1159 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PID1Q7Z2X4 250 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 PEX26Q7Z412 305 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 LRRC57Q8N9N7 239 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GPBAR1Q8TDU6 330 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 OSBPL8Q9BZF1 889 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GPR63Q9BZJ6 419 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 TRHDEQ9UKU6 1024 aa15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 INPP4BO15327 924 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 ASMTLO95671 621 aa15.98■□□□□ 0.15
ATG4B-201ENST00000344376 SLC4A1P02730 911 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms