RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 NXPH1P58417 271 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 LMNB2Q03252 620 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 INPP5AQ14642 412 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TEAD4Q15561 434 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 ALS2CLQ60I27 953 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 AGAP2Q99490 1192 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 IL21RQ9HBE5 538 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 A6NNZ2 444 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 BUD23O43709 281 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 SUN1O94901 812 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TPH1P17752 444 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 SPINT3P49223 89 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GPR63Q9BZJ6 419 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 OR1A2Q9Y585 309 aa20.11■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TMEM131Q92545 1883 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 PSMD3O43242 534 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 SOD1P00441 154 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 APRTP07741 180 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 C21orf59P57076 290 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GPS1Q13098 491 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 PTPRCAPQ14761 206 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 PNCKQ6P2M8 343 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GPR26Q8NDV2 337 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 KCTD3Q9Y597 815 aa20.1■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 H3BQF6 201 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 OVGP1Q12889 678 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 HLA-BQ31612 363 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 C4orf22Q6V702 233 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 MAATS1Q7Z4T9 603 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 SLCO2A1Q92959 643 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 EDEM2Q9BV94 578 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 ARL5AQ9Y689 179 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 CFAP54Q96N23 3096 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 E7EVH7 732 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 ECEL1O95672 775 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 SYPP08247 313 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 BPIP17213 487 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 HMGCLP35914 325 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM23P36406 574 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 DPTQ07507 201 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 CUL1Q13616 776 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 MREGQ8N565 214 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 AP2M1Q96CW1 435 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 APOOQ9BUR5 198 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 LGR4Q9BXB1 951 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 TRABDQ9H4I3 376 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 IL17CQ9P0M4 197 aa20.08■□□□□ 0.81
RAB11B-201ENST00000328024 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 DMXL1Q9Y485 3027 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 MYLKQ15746 1914 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 RABIFP47224 123 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 LMAN1P49257 510 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 MTM1Q13496 603 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 FZD2Q14332 565 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 SHBQ15464 509 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 KCTD16Q68DU8 428 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 NRSN1Q8IZ57 195 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 KRT12Q99456 494 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 GAREM1Q9H706 876 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 CASS4Q9NQ75 786 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 HACD3Q9P035 362 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB11B-201ENST00000328024 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms