RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DCNP07585 359 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGEA9P43362 315 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM151BQ6UXP7 276 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC26A11Q86WA9 606 aa27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa27.36■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1QAP02745 245 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYZAPP0CAP1 466 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPS2Q13227 327 aa27.35■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM124AQ86V42 546 aa27.35■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC44A1Q8WWI5 657 aa27.35■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ETV3P41162 512 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R38P59533 333 aa27.34■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZVL8 140 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAOK1Q7L7X3 1001 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTN4Q8IWV2 1026 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR26Q8NDV2 337 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL26Q9NPH9 171 aa27.34■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRP72O76094 671 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 APBB3O95704 486 aa27.33■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TPMTP51580 245 aa27.33■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 LGSNQ5TDP6 509 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIAA0408Q6ZU52 694 aa27.33■■□□□ 1.97
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAS2R42Q7RTR8 314 aa27.33■■□□□ 1.97
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D3EA0A087X179 549 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa27.31■■□□□ 1.96
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D3LB9A6J9 549 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TM7SF2O76062 418 aa27.31■■□□□ 1.96
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GRTP1Q5TC63 336 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRD1Q6QNK2 874 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 PACS1Q6VY07 963 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFLNAQ6ZTI6 216 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2U1Q7Z449 544 aa27.31■■□□□ 1.96
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX20Q7Z614 316 aa27.31■■□□□ 1.96
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