RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 VPS35Q96QK1 796 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 SLC12A8A0AV02 714 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PHC1P78364 1004 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TEX44Q53QW1 395 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 HECTD3Q5T447 861 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF534Q76KX8 674 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 HAUS8Q9BT25 410 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CACNG3O60359 315 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 DLDP09622 509 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 THOP1P52888 689 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 LRRN4Q8WUT4 740 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PLD4Q96BZ4 506 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PSMD3O43242 534 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 KCNJ13O60928 360 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 FGF18O76093 207 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TBX18O95935 607 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CAPN1P07384 714 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ELK3P41970 407 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TRAF2Q12933 501 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 DNAL1Q4LDG9 190 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GPR107Q5VW38 600 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CYS1Q717R9 158 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PID1Q7Z2X4 250 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GPR141Q7Z602 305 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC33Q8N5R6 958 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF398Q8TD17 642 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TANKQ92844 425 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TEKT5Q96M29 485 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PSKH2Q96QS6 385 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 H3BNX3 289 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 SNPHO15079 494 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 INHBBP09529 407 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 GCAP28676 217 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 EPHB3P54753 998 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 P2RX3P56373 397 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 NRF1Q16656 503 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 FAXCQ5TGI0 409 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 HERVK_113Q902F9 699 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 PSMG2Q969U7 264 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.71□□□□□ -0.05
HOXA3-201ENST00000317201 MATN3O15232 486 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 BGNP21810 368 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 S100A5P33763 92 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM240Q5SV17 173 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 MIB1Q86YT6 1006 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 BADQ92934 168 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 RAD9AQ99638 391 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 IL12RB2Q99665 862 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 NAT9Q9BTE0 207 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 CPQQ9Y646 472 aa14.71□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 ZBBXA8MT70 800 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 CAPN14A8MX76 684 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.061e-10■■■■□ 23.9
HOXA3-201ENST00000317201 MAFKO60675 156 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 PSMB4P28070 264 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 ALDH3B2P48448 385 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 MAPKAPK2P49137 400 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA3-201ENST00000317201 TTC17Q96AE7 1141 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms