RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 RABIFP47224 123 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 DPTQ07507 201 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 GRIK2Q13002 908 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 MTM1Q13496 603 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 GPR26Q8NDV2 337 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 RAD18Q9NS91 495 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 IL17CQ9P0M4 197 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 OR1A2Q9Y585 309 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 KCTD3Q9Y597 815 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SYPP08247 313 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TSHRP16473 764 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 THOP1P52888 689 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PFN3P60673 137 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PDE1BQ01064 536 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRCAPQ14761 206 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 KIF19Q2TAC6 998 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 OR4K2Q8NGD2 314 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 LNP1A1A4G5 178 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 FAM187AA6NFU0 413 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 AP3B1O00203 1094 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP33O14559 1287 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CTAGE8P0CG41 777 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ENGP17813 658 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TGM1P22735 817 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 NXPH1P58417 271 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 BNC1Q01954 994 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC38Q502W7 563 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF534Q76KX8 674 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PCGF5Q86SE9 256 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 AGAP2Q99490 1192 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 APOOQ9BUR5 198 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA16Q9BXB7 569 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CDH19Q9H159 772 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 WDR26Q9H7D7 661 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC78A2IDD5 438 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 LDB2O43679 373 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 IVDP26440 423 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 DCDC1P59894 354 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 YPEL5P62699 121 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TMPRSS15P98073 1019 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 NLRP8Q86W28 1048 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 OR13C4Q8NGS5 318 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SNF8Q96H20 258 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 GDF3Q9NR23 364 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 BFARQ9NZS9 450 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TOR1BO14657 336 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PPFIA2O75334 1257 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 AVILO75366 819 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SOD1P00441 154 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM23P36406 574 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SPAM1P38567 509 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CTSKP43235 329 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 C8orf74Q6P047 294 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CEP112Q8N8E3 955 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 MCUQ8NE86 351 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 SNX24Q9Y343 169 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 LRP4O75096 1905 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 HEATR9A2RTY3 570 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 INPP4BO15327 924 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PYGLP06737 847 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 ADRA1DP25100 572 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 MGAT1P26572 445 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD4-201ENST00000306324 PLA2G5P39877 138 aa22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms